Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN18Q96SJ8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN18Q96SJ8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms