Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSRNP1Q96S65 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms