Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNC2Q96PR1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC2Q96PR1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms