Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM20AQ96MK3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms