Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms