Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms