Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RITA1Q96K30 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RITA1Q96K30 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RITA1Q96K30 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms