Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGBD1Q96JS3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PGBD1Q96JS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms