Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms