Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC97Q96F63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC97Q96F63 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms