Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGF29Q96ES7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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