Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A4Q96EP9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A4Q96EP9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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