Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1LQ96C74 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ROPN1LQ96C74 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms