Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RGP1Q92546 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RGP1Q92546 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms