Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSMEM1Q8WWF3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms