Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC4Q8WW27 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms