Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFT2D1Q8WV19 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D1Q8WV19 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms