Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUJ3

CEMIP, Cell migration-inducing and hyaluronan-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEMIPQ8WUJ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEMIPQ8WUJ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEMIPQ8WUJ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEMIPQ8WUJ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEMIPQ8WUJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEMIPQ8WUJ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms