Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX54Q8TDD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms