Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTOSQ8NHW6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOSQ8NHW6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms