Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC21AQ8NDW8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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