Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AVL9Q8NBF6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AVL9Q8NBF6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms