Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC82Q8N4S0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms