Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF2Q8IX21 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms