Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP13Q86W25 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms