Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLCO4C1Q6ZQN7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms