Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms