Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KSR2Q6VAB6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms