Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms