Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms