Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF544Q6NX49 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms