Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms