Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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