Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HES3Q5TGS1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms