Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDK2Q58EX2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms