Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LACTB2Q53H82 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LACTB2Q53H82 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms