Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms