Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TTLL9Q3SXZ7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TTLL9Q3SXZ7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms