Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD55Q3KP44 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms