Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BSXQ3C1V8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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