Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC57Q2TAC2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC57Q2TAC2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms