Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPP1Q1MSJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms