Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM187BQ17R55 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms