Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFA9Q16795 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms