Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FSCN1Q16658 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms