Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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