Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TNXAQ16473 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNXAQ16473 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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