Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPAQ15257 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPAQ15257 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPAQ15257 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPAQ15257 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPAQ15257 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms