Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRKD1Q15139 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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