Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PCOLCEQ15113 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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